中心创建于2003年10月，占地面积130亩，建筑面积6.8万平方米。2010年被科技部认定为“国家级科技企业孵化器”。
中心现有在孵企业103家，近5年累计毕业企业127家，国家高新技术企业18家，高企入库企业26家，新三板挂牌企业3家，新四板挂牌6家，拥有有效专利689件。中心累计引进千人计划专家6名、博士人才55名，其中海归创业博士35名，共有75人次获得省双创人才计划和市“绿扬金凤”人才计划支持，15人次获得省市创业大赛奖励，获批人才资金超4000万元。
中心成立了扬州邗江高新创业投资有限公司，构筑了中小型科技企业金融服务平台，为企业提供融资担保、风险投资、知识产权质押等多种形式的金融服务，累计近30家企业获得天使、创投资金2862万元。
中心建有江苏省（扬州）数控机床研究院实验室、扬州邗江云智创新实验中心和扬州邗江生物医药创新实验中心等功能性科创平台，构建了完备的技术研发与公共服务体系，建立了创业导师制度和创业企业家联盟，为企业提供研发设计、检测检验、试验试制、转移转化、创业培训等一体化科技创新服务。中心通过创新服务手段，改进服务方式，在培育中小科技企业、发展高新技术产业和战略新兴产业方面发挥了重要作用，已成为区域科技创新创业体系的重要组成部分。