研究院为南京工业大学技术转移中心分中心，是南京工业大学服务连云港市地方经济发展的多主题、专业化创新平台，为南京工业大学紧密结合学科建设在连云港的技术成果转化、科技创新创业的战略基地。研究院采取“组织模式公司化、运营方式市场化、管理团队专业化、服务模式规范化”为运作模式，在体制机制创新上形成特色，通过“五个强化”（强化政策组织引导、强化转移中心职能、强化科技项目孵化、强化创新平台建设、强化校内有机联合），开创技术转移新模式，实现了技术转移服务与投资孵化有机结合，形成了以“科技服务、科技孵化、专利运营、技术集成”四轮驱动的市场化业务体系。

研究院主动发掘企业的技术需求，协助企业研究开发，并为其提供科技成果转移转化、节能环保技术改造服务、中试、工程放大并集成工艺包对外技术转让等服务。通过知识产权授权、技术转让及各项工业技术服务，协助企业提升技术层次和产品附加价值，增强竟争能力，实现企业技术需求与高校科研院所优势技术成果精准对接、高度融合。

研究院建有连云港膜技术推广公共服务平台，丛书膜技术成果推广，积极推进学校优势膜科技成果在地方转移转化；整合学校现有科技和人才优势，与地方企业（尤其是化工企业）开展深度合作，承接课题，主要进行工业废水的达标排放、废气粉尘的净化处理一级化工生产过程中的溶剂回收等小试研究，为膜技术工业化提供小试数据。针对难以达标排放的尾水深度处理，开展高效的膜反应和分离技术研究开发，并在特定的化工产品分离装置中应用学校研究的膜分离成果，提高分离特性，提高产品质量，加大产品的附加值，为环保达标提供技术支撑。推广的“膜技术成果”主要运用在化工、纺织、生物医药、农药等行业的工业尾水及尾气治理。